Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4XP62701 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS4XP62701 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPS4XP62701 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4XP62701 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4XP62701 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4XP62701 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4XP62701 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4XP62701 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4XP62701 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS4XP62701 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4XP62701 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4XP62701 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4XP62701 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4XP62701 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4XP62701 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4XP62701 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4XP62701 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4XP62701 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS4XP62701 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS4XP62701 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4XP62701 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS4XP62701 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4XP62701 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4XP62701 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4XP62701 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4XP62701 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4XP62701 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS4XP62701 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms