Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMP1P54849 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMP1P54849 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMP1P54849 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMP1P54849 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMP1P54849 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMP1P54849 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMP1P54849 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EMP1P54849 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMP1P54849 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMP1P54849 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMP1P54849 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMP1P54849 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMP1P54849 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EMP1P54849 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMP1P54849 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMP1P54849 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMP1P54849 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMP1P54849 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMP1P54849 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMP1P54849 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMP1P54849 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMP1P54849 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMP1P54849 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMP1P54849 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMP1P54849 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMP1P54849 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMP1P54849 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMP1P54849 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms