Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTBP49356 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTBP49356 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTBP49356 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTBP49356 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTBP49356 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTBP49356 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTBP49356 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTBP49356 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTBP49356 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTBP49356 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTBP49356 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTBP49356 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTBP49356 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTBP49356 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTBP49356 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTBP49356 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTBP49356 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTBP49356 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTBP49356 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTBP49356 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTBP49356 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTBP49356 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTBP49356 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTBP49356 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTBP49356 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTBP49356 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTBP49356 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTBP49356 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTBP49356 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTBP49356 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTBP49356 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTBP49356 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTBP49356 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTBP49356 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTBP49356 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTBP49356 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTBP49356 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTBP49356 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTBP49356 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTBP49356 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTBP49356 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTBP49356 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNTBP49356 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNTBP49356 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNTBP49356 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNTBP49356 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTBP49356 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTBP49356 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTBP49356 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTBP49356 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTBP49356 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTBP49356 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTBP49356 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTBP49356 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTBP49356 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTBP49356 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FNTBP49356 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTBP49356 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTBP49356 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTBP49356 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTBP49356 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTBP49356 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTBP49356 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTBP49356 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTBP49356 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTBP49356 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTBP49356 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTBP49356 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms