Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDXP35241 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDXP35241 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDXP35241 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDXP35241 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RDXP35241 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDXP35241 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDXP35241 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RDXP35241 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDXP35241 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDXP35241 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDXP35241 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDXP35241 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDXP35241 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDXP35241 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDXP35241 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDXP35241 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDXP35241 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDXP35241 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDXP35241 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDXP35241 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDXP35241 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDXP35241 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDXP35241 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDXP35241 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDXP35241 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDXP35241 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDXP35241 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDXP35241 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDXP35241 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDXP35241 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDXP35241 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDXP35241 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDXP35241 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDXP35241 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDXP35241 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDXP35241 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDXP35241 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDXP35241 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDXP35241 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDXP35241 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDXP35241 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDXP35241 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDXP35241 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDXP35241 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RDXP35241 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDXP35241 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDXP35241 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms