Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC8A1P32418 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms