Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITPKAP23677 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITPKAP23677 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITPKAP23677 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms