Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITPKAP23677 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITPKAP23677 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITPKAP23677 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITPKAP23677 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITPKAP23677 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITPKAP23677 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITPKAP23677 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ITPKAP23677 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITPKAP23677 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITPKAP23677 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITPKAP23677 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITPKAP23677 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITPKAP23677 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITPKAP23677 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITPKAP23677 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITPKAP23677 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITPKAP23677 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITPKAP23677 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITPKAP23677 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITPKAP23677 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITPKAP23677 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITPKAP23677 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITPKAP23677 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITPKAP23677 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITPKAP23677 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITPKAP23677 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITPKAP23677 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ITPKAP23677 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITPKAP23677 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITPKAP23677 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITPKAP23677 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITPKAP23677 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITPKAP23677 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ITPKAP23677 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ITPKAP23677 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITPKAP23677 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITPKAP23677 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITPKAP23677 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ITPKAP23677 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITPKAP23677 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITPKAP23677 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITPKAP23677 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITPKAP23677 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITPKAP23677 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITPKAP23677 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ITPKAP23677 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITPKAP23677 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITPKAP23677 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITPKAP23677 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITPKAP23677 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITPKAP23677 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITPKAP23677 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ITPKAP23677 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITPKAP23677 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITPKAP23677 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITPKAP23677 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITPKAP23677 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITPKAP23677 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITPKAP23677 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITPKAP23677 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITPKAP23677 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITPKAP23677 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITPKAP23677 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITPKAP23677 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITPKAP23677 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITPKAP23677 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITPKAP23677 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITPKAP23677 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITPKAP23677 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITPKAP23677 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITPKAP23677 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITPKAP23677 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITPKAP23677 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITPKAP23677 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITPKAP23677 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITPKAP23677 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITPKAP23677 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITPKAP23677 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITPKAP23677 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITPKAP23677 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITPKAP23677 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITPKAP23677 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITPKAP23677 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITPKAP23677 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITPKAP23677 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITPKAP23677 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITPKAP23677 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITPKAP23677 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ITPKAP23677 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITPKAP23677 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITPKAP23677 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITPKAP23677 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITPKAP23677 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITPKAP23677 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITPKAP23677 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITPKAP23677 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITPKAP23677 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITPKAP23677 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITPKAP23677 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms