Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTRP02766 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTRP02766 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTRP02766 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTRP02766 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTRP02766 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTRP02766 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTRP02766 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TTRP02766 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTRP02766 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTRP02766 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTRP02766 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTRP02766 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTRP02766 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTRP02766 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTRP02766 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTRP02766 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTRP02766 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTRP02766 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTRP02766 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTRP02766 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTRP02766 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTRP02766 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTRP02766 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTRP02766 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTRP02766 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTRP02766 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTRP02766 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTRP02766 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTRP02766 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTRP02766 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTRP02766 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTRP02766 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTRP02766 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTRP02766 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTRP02766 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTRP02766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTRP02766 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTRP02766 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TTRP02766 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTRP02766 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTRP02766 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTRP02766 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTRP02766 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTRP02766 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTRP02766 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTRP02766 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTRP02766 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTRP02766 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTRP02766 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTRP02766 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTRP02766 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTRP02766 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTRP02766 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTRP02766 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTRP02766 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTRP02766 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTRP02766 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTRP02766 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTRP02766 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTRP02766 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTRP02766 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTRP02766 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTRP02766 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTRP02766 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTRP02766 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTRP02766 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTRP02766 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTRP02766 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms