Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOA1P02647 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOA1P02647 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOA1P02647 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOA1P02647 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOA1P02647 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOA1P02647 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOA1P02647 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOA1P02647 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOA1P02647 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOA1P02647 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOA1P02647 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOA1P02647 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOA1P02647 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOA1P02647 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOA1P02647 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOA1P02647 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOA1P02647 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOA1P02647 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOA1P02647 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOA1P02647 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOA1P02647 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOA1P02647 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOA1P02647 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOA1P02647 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOA1P02647 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOA1P02647 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOA1P02647 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOA1P02647 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOA1P02647 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOA1P02647 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOA1P02647 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOA1P02647 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOA1P02647 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOA1P02647 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOA1P02647 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOA1P02647 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOA1P02647 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOA1P02647 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
APOA1P02647 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOA1P02647 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms