Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZIC2O95409 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZIC2O95409 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms