Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF5BO60841 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
EIF5BO60841 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF5BO60841 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms