Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHMP2AO43633 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms