Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CCER2I3L3R5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCER2I3L3R5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCER2I3L3R5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms