Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPH6UMI1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms