Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF487B1APH4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms