Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TVP23AA6NH52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms