Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRCP1A6NGW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
STRCP1A6NGW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
STRCP1A6NGW2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms