Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM43BA6NCK2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43BA6NCK2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43BA6NCK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms