Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms