Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOP08100 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHOP08100 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms