Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PRAMEF10O60809 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PRAMEF10O60809 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PRAMEF10O60809 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PRAMEF10O60809 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PRAMEF10O60809 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PRAMEF10O60809 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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