Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms