Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP2P78314 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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