Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFKQ969G6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms