Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAPQ14761 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms