Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms