Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms