Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HIF3AQ9Y2N7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HIF3AQ9Y2N7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HIF3AQ9Y2N7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIF3AQ9Y2N7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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