Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms