Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms