Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms