Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CLIP4Q8N3C7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CLIP4Q8N3C7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLIP4Q8N3C7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLIP4Q8N3C7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLIP4Q8N3C7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLIP4Q8N3C7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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