Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms