Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VBP1P61758 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VBP1P61758 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VBP1P61758 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VBP1P61758 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VBP1P61758 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VBP1P61758 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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VBP1P61758 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VBP1P61758 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VBP1P61758 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VBP1P61758 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VBP1P61758 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VBP1P61758 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VBP1P61758 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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