Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP2B2Q01814 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP2B2Q01814 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP2B2Q01814 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP2B2Q01814 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP2B2Q01814 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP2B2Q01814 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP2B2Q01814 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms