Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPFIA3O75145 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms