Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G7

PCDHGA6, Protocadherin gamma-A6, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA6Q9Y5G7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA6Q9Y5G7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA6Q9Y5G7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms