Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP2Q9UHC6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms