Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAMTOR3Q9UHA4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms