Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EBF1Q9UH73 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF1Q9UH73 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF1Q9UH73 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms