Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
REREQ9P2R6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
REREQ9P2R6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
REREQ9P2R6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms