Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9Q9P2J2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF9Q9P2J2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms