Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFCQ9NRA1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFCQ9NRA1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFCQ9NRA1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms