Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL1Q9NR64 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms