Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTA1Q9NP79 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTA1Q9NP79 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms