Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF1Q9HCE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms