Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF408Q9H9D4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF408Q9H9D4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms