Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF7Q9BWX1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHF7Q9BWX1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms