Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF18Q99633 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms