Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
KCNH8Q96L42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KCNH8Q96L42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KCNH8Q96L42 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms